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基因芯片数据库,基因芯片数据库有哪些

时间:2024-08-15 11:41:35作者:科学知识网 分类: 芯片 浏览:0

大家好,今天小编关注到一个比较有意思的话题,就是关于基因芯片数据库的问题,于是小编就整理了2个相关介绍基因芯片数据库的解答,让我们一起看看吧。

oncomine数据库全称?

Oncomine是肿瘤基因芯片数据库。

基因芯片数据库,基因芯片数据库有哪些

如果你获得了一个肿瘤差异表达基因,想研究其是否可作为某种肿瘤的潜在标志物和靶点,又怕做实验会得到阴性结果,浪费时间和金钱,这时可以用到Oncomine。

Oncomine整合了GEO、TCGA和已发表的文献等来源的RNA和DNA-seq数据,只要你用非营利机构邮箱注册了就可以免费使用。

Oncomine 是目前世界上最大的肿瘤基因芯片数据库和整合数据挖掘平台,旨在挖掘癌症基因信息。Oncomine 拥有最全的癌症突变谱、基因表达数据以及相关的临床信息,可用于发现新的生物标记物或新的治疗靶点。

通过Oncomine,可以进行差异表达分析,共表达分析,查找某种癌症中差异表达的基因,确定目的基因,确定研究方向。

怎么寻找基因名称?

寻找基因名称的方法可以通过以下几个途径进行:

1. 基因数据库:许多公共数据库都提供了基因名称的信息,如NCBI、Ensembl和UCSC等。你可以在这些数据库中搜索特定的基因,获取其官方名称和别名。

2. 文献检索:通过搜索相关的研究论文或综述文章,可以找到基因名称的信息。在科学文献中,通常会包含该基因的官方名称和别名,以及与该基因相关的实验结果和研究成果。

3. 基因注释工具:一些基因注释工具如DAVID(Database for Annotation, Visualization, and Integrated Discovery)、GeneCards和UniProt等提供了基因名称的注释和查询功能。通过输入基因相关的信息(如序列、ID或别名),这些工具能够帮助你找到基因的官方名称和其他注释信息。

4. 基因家族数据库:基因常常以家族的形式出现,你可以通过访问基因家族数据库如Pfam、InterPro和Gene Ontology等来查找基因的名称和分类信息。

要寻找基因名称,可以尝试以下几种方法:

1. 使用基因数据库:访问公共基因组数据库如NCBI、Ensembl或GenBank,通过关键词搜索或基因序列比对来找到感兴趣的基因。

2. 使用基因注释工具:使用基因注释工具如DAVID、STRING或GeneCards,输入相关信息如基因功能、序列或蛋白质互作来查找基因名称。

3. 文献研究:阅读相关研究论文,特别是涉及你感兴趣领域的研究,文中通常会提到基因名称。

4. 与专家交流:与领域专家、同行或导师交流,他们可能知道你感兴趣的基因名称或能提供指导。

5. 基因组挖掘:使用基因组挖掘工具如BLAST或HMMER,在已知基因中寻找与你感兴趣的基因有相似序列的基因。

希望这些方法能帮到你,祝你找到理想的基因名称!如果你还有其他问题,欢迎继续提问。

1 打开NCBI主页2 左边search里面选择GENE 右边的对话框里输入你想要的基因名称3 在出来的所有条目第一行后面都有种属表明,比如Homo sapiens是人Felis catus是猫。选择你想要的种属。

4 再出现的页面中找到那个像数轴的图,在左侧有可以点击的蓝色数字,往往开头有AK、NM的开头,点击它,再出现的下拉框里选择GENEBANK。

5 最下面就是他的基因序列 当然也可以参考页面上提供的CDS区域范围来看。

到此,以上就是小编对于基因芯片数据库的问题就介绍到这了,希望介绍关于基因芯片数据库的2点解答对大家有用。

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